Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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