Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MttpO08601 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
MttpO08601 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MttpO08601 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms