Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms