Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms