Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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