Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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