Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ddb2Q99J79 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms