Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms