Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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