Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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