Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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