Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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