Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Pkp1P97350 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms