Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
VdrP48281 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
VdrP48281 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms