Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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