Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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