Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms