Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd4P10628 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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