Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms