Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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H2-M5A7VMS3 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
H2-M5A7VMS3 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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