Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hdac6Q9Z2V5 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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