Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnf4Q9QZS2 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms