Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms