Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Syf2Q9D198 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms