Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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