Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Fam20bQ8VCS3 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms