Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
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Atg4aQ8C9S8 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Atg4aQ8C9S8 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Atg4aQ8C9S8 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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