Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms