Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Znf48Q3US17 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Znf48Q3US17 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Znf48Q3US17 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Znf48Q3US17 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Znf48Q3US17 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Znf48Q3US17 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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