Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trim71Q1PSW8 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms