Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp2Q06649 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Sh3bp2Q06649 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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