Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms