Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RxraP28700 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RxraP28700 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms