Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PdgfraP26618 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PdgfraP26618 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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