Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Vpreb2P13373 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms