Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Grik3B1AS29 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms