Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Rtf1A2AQ19 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms