Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrit3W8DXL4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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