Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc166S4R181 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms