Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt27Q9Z320 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt27Q9Z320 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms