Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CcniQ9Z2V9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CcniQ9Z2V9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms