Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hdac5Q9Z2V6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac5Q9Z2V6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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