Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne6Q9Z140 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms