Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nup160Q9Z0W3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup160Q9Z0W3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms