Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapaQ9WV55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapaQ9WV55 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms