Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrQ9WUZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms