Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skp1Q9WTX5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skp1Q9WTX5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms