Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpc2Q9R244 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc2Q9R244 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms