Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zeb2Q9R0G7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms