Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lamc3Q9R0B6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Lamc3Q9R0B6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lamc3Q9R0B6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms